Исследование «DeMaRes»

Анализ распространенности мутаций резистентности к макролидам и фторхинолонам у Mycoplasma genitalium и Mycoplasma pneumoniae

Опубликовано 8 апреля 2021 Просмотров: 0 Переходов: 0
МАКМАХ НИИАХ
Открыть

Организаторы

  • Межрегиональная ассоциация по клинической микробиологии и антимикробной химиотерапии (МАКМАХ)
  • НИИ антимикробной химиотерапии (НИИАХ), ФГБОУ ВО Смоленский государственный медицинский университет (СГМУ) Минздрава России

Аннотация

Mycoplasma genitalium является одним из облигатных патогенов, и доказано вызывает уретриты у мужчин, цервициты и эндометриты у женщин, а также осложняет течение беременности и родов.

Mycoplasma pneumoniae - это «атипичный» бактериальный патоген, вызывающий инфекции нижних дыхательных путей, включая пневмонию и трахеобронхит, и, реже, инфекции верхних дыхательных путей. Эпидемиологической особенностью M. pneumoniae является возможность вызывать вспышки в организованных коллективах с тесными контактами (в дошкольных, школьных и студенческих группах, у военнослужащих и др.), возможны семейные случаи инфекции.

В данном исследовании представлены результаты анализа распространенности генетических детерминант резистентности к макролидам (мутации в домене V гена 23S рРНК) и фторхинолонам (мутации в областях, определяющих устойчивость к хинолонам (QRDR) генов gyrA и parC) M. genitalium и M. pneumoniae.

Протокол исследования

Источники клинических образцов

Mycoplasma genitalium — положительные по результатам ПЦР образцы (n=873) из пяти городов России: Москвы, Нижнего Новгорода, Саратова, Смоленска и Тулы были собраны в период с 2009-2019 гг.

Mycoplasma pneumoniae — положительные по результатам ПЦР образцы (n=1480) из двенадцати городов России: Брянска, Екатеринбурга, Красноярска, Москвы и Московской области, Нижнего-Новгорода, Республики Марий Эл, Пензы, Смоленска, Тулы, Хабаровска и Ярославля были собраны в период с 2006-2020 гг.

Все образцы были собраны в рамках рутинной диагностики мочеполовых и респираторных инфекций и не повторялись (представляли отдельных пациентов / случаи инфекции). ПЦР-положительные образцы были направлены в центральную лабораторию НИИАХ для анализа мутаций, связанных с устойчивостью к антибиотикам.

Выявление мутаций в V домене 23S рРНК и в QRDR генов parC и gyrA

Однонуклеотидные замены в положениях 2058-2062 и 2611 домена V 23S рРНК и мутации, вызывающие изменения аминокислот (аа) в областях QRDR ParC (положения аа 79-84) и GyrA (положения аа 83-87) были обнаружены с помощью зондовых ПЦР-анализов в реальном времени и были подтверждены независимой ПЦР-амплификацией и секвенированием по Сэнгеру соответствующих фрагментов гена [2-4].

Данные о типах обнаруженных мутаций представлены в разделе «Маркеры» на сайте.

Исследовательская группа:

Лаборатория НИИАХ:

  • Эйдельштейн И.А.,
  • Романов А.В.,
  • Эйдельштейн М.В.,
  • Кузьменков А.Ю.,
  • Козлов Р.С.

Участвующие центры:

  • Аксютина Галина Владимировна (ФБУЗ «Центр Гигиены и Эпидемиологии в Брянской области», Брянск)
  • Алябьева Наталья Александровна (ФГАУ «НМИЦ здоровья детей», Москва)
  • Борисов Игорь Викторович (ФГБУ ИБФРМ РАН, Саратов)
  • Грошенкова Елена Валентиновна (ФБУЗ «Центр Гигиены и Эпидемиологии в Ярославльской области», Ярославль)
  • Гущин Александр Евгеньевич (ГБУЗ «Московский Центр дерматовенерологии и косметологии», Москва)
  • Ершова Марина Геннадьевна (Инфекционная клиническая больница, ГБУЗ ЯО, Ярославль)
  • Еникеева Фарида Шавкатовна (ГБУЗ «Пензенский областной клинический центр специализированных видов медицинской помощи», Пенза)
  • Зайцев Андрей Алексеевич (ФГКУ «Главный военный клинический госпиталь им. академика Н.Н. Бурденко», Москва)
  • Зубарева Людмила Михайловна (ОГБУЗ СКВД, Смоленск)
  • Игнатькова Антонина Сергеевна (ФБУЗ «Центр Гигиены и Эпидемиологии в Тульской области», Тула)
  • Иванова Ольга Владимировна (Филиал № 4 ФГКУ «1586 Военного клинического госпиталя», Смоленск)
  • Иванова Ирина Анатольевна (ГБУ РМЭ «РЦПБ СПИД и ИЗ», Йошкар-Ола)
  • Колесникова Елена Александровна (Клиника «УльтраМед», Нижний Новгород)
  • Маджарова Ольга Анатольевна (ГУ «Республиканский клинический медицинский центр» Управления делами Президента Республики Беларусь, Минск)
  • Новикова Ольга Петровна (Клиника «Консультант», Тула)
  • Оленькова Ольга Михайловна (МАУ «Клинико-диагностический центр», Екатеринбург)
  • Плескачевская Татьяна Александровна (СГМУ, Смоленск)
  • Протасова Ирина Николаевна (ФГБОУ ВО КрасГМУ им. проф. В.Ф. Войно-Ясенецкого, Красноярск)
  • Руднева Наталья Сергеевна (ГУЗ «ТОККВД», Тула)
  • Семенова Ольга Леонидовна (ФБУЗ «Центр Гигиены и Эпидемиологии в Брянской области», Брянск)
  • Сперанская Елена Валентиновна (НИИЭ и М им. Блохиной, Нижний Новгород)
  • Цихановская Оксана Анатольевна (ГБУЗ «Центр специализированных видов медицинской помощи им. В.П. Аваева», Тверь)
  • Яцышина Светлана Борисовна (ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва)

Координатор проекта

Эйдельштейн Инна Александровна

Руководитель лаборатории молекулярной диагностики НИИ антимикробной химиотерапии
ФГБОУ ВО «СГМУ» Минздрава России

inna.edelstein@antibiotic.ru

НИИ антимикробной химиотерапии ФГБОУ ВО «СГМУ» Минздрава России

Основные публикации

  1. Эйдельштейн И.А. Mycoplasma pneumoniae – современные данные о строении, молекулярной биологии и эпидемиологии возбудителя. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2023; 25(4):332-349. DOI: 10.36488/cmac.2023.4.332-349
  2. Edelstein I.A., Guschin A.E., Romanov A.V., Negasheva E.S., Kozlov R.S. Genetic Determinants of Macrolide and Fluoroquinolone Resistance in Mycoplasma genitalium and Their Prevalence in Moscow, Russia. Pathogens. 2023; 12(3):496. DOI: 10.3390/pathogens12030496
  3. Edelstein I.A., Romanov A.V., Kozlov R.S. Development of a Real-Time PCR Assay for Detection of Macrolide Resistance Mutations in Mycoplasma genitalium and Its Application for Epidemiological Surveillance in Russia. Microbial Drug Resistance.Mar 2023.69-77. DOI: 10.1089/mdr.2022.0131
  4. Edelstein, I.A.; Ivanova, O.V.; Romashov, O.I.; Kozlov, R.S. Course of Lower Respiratory Tract Infection in Young People Treated at the Military Hospital of Smolensk Garrison with Detected Mycoplasma pneumoniae Carrying a Macrolide-Resistant Mutation in 23S rRNA Gene. Pathogens 2023, 12, 103. DOI: 10.3390/pathogens12010103
  5. Эйдельштейн И.А., Руднева Н.С., Романов А.В., Зубарева Л.М., Кузьменков А.Ю., Колесникова Е.А., Трушин И.В., Борисов И.В., Суханова Л.Н., Ахмедова А.М., Новикова О.П., Козлов Р.С. Mycoplasma genitalium: мониторинг распространения мутаций, связанных с резистентностью к макролидам в России. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2022; 24(1):52-60. DOI: 10.36488/cmac.2022.1.52-60.
  6. Патент на изобретение RU 2778666 C1. 22.08.2022. Заявка № 2021128513 от 27.09.2021. Способ выявления мутаций в участках генов parC и gyrA QRDR, приводящих к резистентности у Mycoplasma genitalium к антибиотикам фторхинолонового ряда. Романов А.В., Козлов Р.С., Эйдельштейн И.А., Эйдельштейн М.В. Ref.
  7. Иванова О.В., Эйдельштейн И.А., Ромашов О.И., Козлов Р.С. Оценка влияния мутаций в гене 23S рРНК Mycoplasma pneumoniae, обуславливающих устойчивость к макролидам, на тяжесть течения внебольничной пневмонии у лиц молодого возраста, находившихся на лечении в Смоленском военном госпитале. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2020; 22(4):306-312. DOI: 10.36488/cmac.2020.4.306-312.
  8. Зубарева Л.М., Эйдельштейн И.А., Руднева Н.С., Романов А.В., Власова Т.А., Лавриненкова Ю.В., Суханова Л.Н., Ахмедова А.М., Кузьменков А.Ю., Трушин И.В., Евстафьев В.В. Распространенность ассоциированных с устойчивостью к макролидам мутаций у Mycoplasma genitalium среди пациентов с негонококковыми инфекциями, передающимися половым путём, в Смоленске и Туле. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2019; 21(4):330-339. DOI: 10.36488/cmac.2019.4.330-339
  9. Зубарева Л.М., Эйдельштейн И.А., Романов А.В., Евстафьев В.В., Козлов Р.С. Клинический случай неуспеха терапии джозамицином у пациента с уретритом, вызванным Mycoplasma genitalium. Вестник дерматологии и венерологии. 2018;(4):55-59. DOI: 10.25208/0042-4609-2018-94-4-55-59
  10. Эйдельштейн И.А., Эйдельштейн М.В., Романов А.В., Зайцев А.А., Раковская И.В., Бархатова О.И., Антипушина Д.Н., Козлов Р.С. Четыре случая выявления мутаций устойчивости в гене 23S рРНК Mycoplasma pneumoniae, выделенных от военнослужащих с пневмонией, находящихся на лечении в военном госпитале. Клиническая Микробиология и Антимикробная Химиотерапия. 2017; 19(3):248-253 Ref.
  11. Патент на изобретение RU 2646123 C1, 01.03.2018. Заявка № 2017133677 от 27.09.2017. Способ выявления мутаций, приводящих к резистентности у Mycoplasma genitalium и Mycoplasma pneumoniae к макролидным антибиотикам. Романов А.В., Козлов Р.С., Эйдельштейн И.А., Эйдельштейн М.В. Ref.
  12. Эйдельштейн И.А., Эйдельштейн М.В., Романов А.В., Рачина С.А., Яцышина С.Б., Раковская И.В., Козлов Р.С. Выявление мутаций устойчивости к макролидам в гене 23S рРНК Mycoplasma pneumoniae с помощью полимеразной цепной реакции в режиме реального времени. Тихоокеанский медицинский журнал. 2015;(1):63-66. Ref.
  13. Shipitsyna E, Rumyantseva T, Golparian D, Khayrullina G, Lagos AC, Edelstein I, Joers K, Jensen JS, Savicheva A, Rudneva N, Sukhanova L, Kozlov R, Guschin A, Unemo M. Prevalence of macrolide and fluoroquinolone resistance-mediating mutations in Mycoplasma genitalium in five cities in Russia and Estonia. PLoS One. 2017. Apr 13; 12(4). DOI: 1371/journal.pone.0175763
  14. Edelstein I., Rachina S., Touati A., Kozlov R., Henin N., Bébéar C., Pereyre S. Mycoplasma pneumoniae Monoclonal P1 Type 2c, Outbreak, Russia, 2013. Emerging Infectious Diseases. Vol. 22, No. 2, February 2016. DOI: 10.3201/eid2202.151349
  15. Бобылев А.А., Рачина С.А., Эйдельштейн И.А., Козлов Р.С., Герман С.В., Погодин А.Г. Описание вспышки инфекции, вызванной Mycoplasma pneumoniae, в Смоленской области. Пульмонология. 2013;(5):97-100. Ref