Экспорт из ЛИС «Патоген» в AMRcloud

Руководство «Экспорт из ЛИС «Патоген» в AMRcloud» рассказывает о том, как имеющиеся у вас данные из ЛИС «Патоген» подготовить для загрузки в онлайн-платформу AMRcloud.

ЛИС «Патоген» имеет встроенный готовый отчет Выгрузка в AMRcloud. Его можно найти в боковом меню программы в разделе Отчеты. По умолчанию выгружаются все данные с момента начала использования ЛИС «Патоген».

Выбор отчета

При необходимости можно отфильтровать данные по следующим параметрам:

  • раздел микроорганизмов,
  • антибиотикограммы,
  • микроорганизм,
  • дата регистрации (можно задать период),
  • источник,
  • материал.

Все параметры, кроме даты регистрации, имеют множественный выбор, то есть можно выбрать все группы микроорганизмов, а можно выбрать 1, 2 или более группы, те, которые вам нужны для выборки.

Заполнение фильтров выборки

После указания всех фильтров, при нажатии кнопки Найти, сформируется отчет согласно выбранным параметрам с обязательными полями:

  • идентификатор изолята,
  • дата,
  • вид микроорганизма,
  • группа микроорганизма,
  • клинический материал,
  • отделение.

Дополнительно выводятся данные о маркерах резистентности. Далее таблица состоит из столбцов с наименованиями антимикробных препаратов и результатами определения чувствительности. ЛИС «Патоген» выгружает данные диаметров зон подавления роста и данные минимальных подавляющих концентраций.

Пример сформированного отчета

Чтобы сформировать файл для загрузки в платформу AMRcloud, нужно справа сверху нажать кнопку Экспорт в .csv, автоматически произойдет скачивание файла в формате таблицы Excel.

Выгрузка отчета в формат CSV

Готовый отчет можно найти в папке Загрузки вашего браузера.

Отчет, открытый в программе MS Excel
Созданный файл может быть загружен в AMRcloud для анализа. Как загрузить полученный файл подробно описано в Руководстве «AMRcloud. Импорт данных»